FILOThèque - Le parcours d'un échantillon

1. Prélèvement et acheminement

• Prélèvements du sang, de la moelle, de la salive et des bulbes de cheveux.
• Réalisés au diagnostic de la maladie, tout au long du suivi du traitement et à la rechute.
• Envoyés par environ 60 centres hospitaliers français.
• Acheminé en 24H à la Filothèque par un transporteur agréé.

 2. Réception et enregistrement

• Réception des prélèvements dans une zone dédiée.
• Contrôle de conformité aux critères d’acceptation (consentement du patient, anonymisation et exactitude des données).
• Codification et enregistrement dans la base de données Tumorotek.

 3. Traitement des prélèvements

• Les prélèvements sont traités dans un laboratoire L2 selon un mode opératoire standard et validé.
• Selon le protocole, de nouvelles méthodes peuvent être mises au point.
• Le traitement consiste en :
  • Préparation de sérum et de plasma
  • Séparation cellulaire sur gradient de Ficoll
  • Tri-cellulaire CD19
  • Réalisation de contrôle qualité (viabilité et marquage cellulaires).
  • Congélation des échantillons plasmatiques et cellulaires

4. Transformation des échantillons

• Les échantillons cellulaires sont transformés en acides nucléiques dans une zone dédiée.
• L’ADN et l’ARN cellulaires sont extraits sur l’automate Maxwell ou Qiacube.
• L’ADN salivaire est extrait sur l’automate Evo-HSM.
• Des contrôles qualité sont réalisés pour vérifier l’intégrité et l’absence de contamination des acides nucléiques.

5. Conservation

• Les échantillons et produits dérivés sont conservés en miroir.
• Les plasmas, cellules en culots secs, cellules en trizol et les acides nucléiques sont conservés à -80°. Les cellules viables sont conservées en azote.
• Les cryo-conservateurs sans sous surveillance permanente dans locaux à accès contrôlé.
• Des cryo-conservateurs de secours sont disponibles.